重點實驗室是國家環(huán)保科技創(chuàng)新體系的重要組成部分，是組織環(huán)境領域基礎研究和應用基礎研究、聚集和培養(yǎng)優(yōu)秀環(huán)保科技人才、開展學術交流、促進學科發(fā)展的重要基地，是開展環(huán)保科技國際合作的重要平臺。
2012年12月11日，環(huán)境保護部下發(fā)《關于加強國家環(huán)境保護重點實驗室建設的指導意見》，根據(jù)該指導意見，到2015年，在涉及當前和今后 一段時期國家環(huán)保工作的重點領域和學科方向，新建成10個左右重點實驗室，到2020年，再建成10個左右重點實驗室，基本建成與國家環(huán)境保護管理決策科 技需求相適應的重點實驗室體系。重點領域與方向：水污染防治領域；河流環(huán)境模擬與污染控制、地下水環(huán)境模擬與污染控制、農(nóng)村面源污染控制等方向；大氣污染 防治領域；固體廢物污染防治與化學品管理領域；生態(tài)保護和建設領域；土壤污染防治領域；環(huán)境與健康領域；環(huán)境監(jiān)管技術領域；核與輻射安全領域；全球環(huán)境問 題研究領域以及環(huán)保功能材料研究、重金屬污染防治等方向。
根據(jù)環(huán)保部網(wǎng)站20號信息，截至目前已經(jīng)通過驗收并命名的重點實驗室有19個，批準建設的重點實驗室11個。其中，2013年2月16日，又一 重點實驗室——以清華大學為依托單位的國家環(huán)境保護大氣復合污染來源與控制重點實驗室通過環(huán)保部批復，該實驗室建設期兩年，面向我國環(huán)境保護戰(zhàn)略需求，圍 繞大氣復合污染源排放表征理論與技術方法、大氣復合污染多維溯源理論與技術方法、大氣復合污染控制和空氣質量管理科技支撐平臺等方向，開展大氣復合污染來 源與控制領域的前瞻性和應用性研究，培養(yǎng)一批優(yōu)秀的創(chuàng)新型骨干人才和領軍人才，努力建設產(chǎn)學研聯(lián)盟，建成國際一流水平的重點實驗室和開放性交流服務平臺， 為區(qū)域大氣污染聯(lián)防聯(lián)控提供技術支撐和決策支持。
另據(jù)環(huán)保部信息，截止2012年10月12日，已經(jīng)有14個工程技術中心通過驗收并命名，16個工程技術中心批準建設。
國家環(huán)境保護重點實驗室名單
一、通過驗收并命名的重點實驗室：
二、批準建設的重點實驗室：
國家環(huán)境保護工程技術中心名單
一、通過驗收并命名的工程技術中心：
二、批準建設的工程技術中心：